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基础标准 AI 结构化解析
GB/T33767.14-2023 信息技术 生物特征样本质量 第 14 部分: DNA 数据 Information technology—Biometric sample quality—Part 14: DNA data
发布日期 2023-03-17
实施日期 2023-10-01
替代标准 —
解析引擎 v3.4
适用范围 本文件提出了在生物特征识别中高通量测序产生的 DNA 数据类型, 规定了 DNA 数据质量要求以及对应的 DNA 数据质量测试方法。本文件适用于生物特征识别中高通量测序产生 DNA 数据的质量评价。
13 参数限值 7 试验方法 6 计算公式 19 术语 13 约束 2 引用
解析版本
AI 问答 术语 限值速查 限值判定 试验方法 计算公式 约束条件 引用标准 能力表述 质检复核
高通量测序3.1
区别于传统 Sanger(双脱氧法)测序,能够一次并行对大量核酸分子进行平行序列测定的技术。注:通常一次测序反应能产出不低于100 Mb的测序数据。
DNA 分型3.2
利用生物学检测方法测定个体 DNA 序列,并将其与参考 DNA 序列进行比对,以确定该个体基因型的过程。
数据质量3.3
在指定条件下使用时,数据的特性满足明确的和隐含的要求程度。
DNA 数据3.4
高通量测序后得到的原始数据、信息分析过程中的比对数据和 DNA 分型数据。
核酸序列3.5
核酸的一级结构,使用一串字母表示的携带基因信息的 DNA 分子的一级结构。
FASTQ 格式3.6
基于文本的、保存生物序列(通常是核酸序列)和其测序质量信息的、每四行表示一条序列的标准格式。
碱基识别3.7
测序过程中从荧光信号或其他测序反应产生的信号转换成碱基序列信息的过程。
碱基质量值3.8
碱基识别出错的概率的整数映射,用来衡量碱基正确识别的概率。注:通常以数字值直接表示。
测序片段3.9
高通量测序平台产生的含有碱基序列和质量值的序列片段。
读长3.10
高通量测序仪单次测序所得到的平均碱基序列长度。
覆盖度3.11
测序序列与参考序列比对时,所有比对成功的区域占参考序列总区域的百分比。
序列比对3.12
比较两个或两个以上核酸序列间的相似性的过程。
参考序列3.13
测序片段对应的物种基因组序列。
短串联重复序列3.14
染色体上重复单位为 2 bp~6 bp 的串联重复序列,表现出高度的个体差异。
单核苷酸多态性3.15
由单个核苷酸改变所引起的脱氧核糖核酸序列多态性。
目标区域3.16
包含目标短串联重复序列或单核苷酸多态性位点的基因组区域。
基因型3.17
个体的一个或多个基因座上等位基因的组成。注:本文件中特指 SNP 或 STR 位点的等位基因组成。
测序深度3.18
测序样本中目标区域核苷酸被检测到的次数。
测序芯片3.19
高通量测序中为待测 DNA 分子提供测序反应场所的容器。注:测序芯片是高通量测序的核心部件,具有吸附移动 DNA 片段的通道,测序文库中的 DNA 片段在通过通道时会随机附着在通道表面。
DNA测序数据准确率
DNA测序数据
≥ 99 % (DNA测序数据)%6.1.1
DNA比对数据准确率
DNA比对数据
≥ 95 % (DNA比对数据)%6.1.2
DNA分型数据准确率
DNA分型数据
≥ 98 % (DNA分型数据)%6.1.3
DNA测序数据可追溯信息一致性
DNA测序数据
≥ 100 % (DNA测序数据可追溯信息与DNA样本可追溯信息)%6.3.2
DNA比对数据可追溯信息一致性
DNA比对数据
≥ 100 % (DNA比对数据可追溯信息与DNA样本可追溯信息)%6.3.3
DNA分型数据可追溯信息一致性
DNA分型数据
≥ 100 % (DNA分型数据可追溯信息与DNA样本可追溯信息)%6.3.4
读长
DNA测序数据
≥ 50 bp (DNA测序数据准确性测试)bp7.2.1 a) 2)
Q30
DNA测序数据
≥ 85 % (DNA测序数据准确性测试)%7.2.1 a) 3)
读长
DNA比对数据
≥ 50 bp (DNA比对数据准确性测试)bp7.2.2 a) 1)
目标区域的覆盖度
DNA比对数据
≥ 95 % (DNA比对数据准确性测试)%7.2.2 a) 2)
目标区域的平均测序深度
DNA比对数据
≥ 100 倍 (DNA比对数据准确性测试)倍7.2.2 a) 3)
目标区域的覆盖度
DNA分型数据
≥ 95 % (DNA分型数据准确性测试)%7.2.3 a) 1)
目标区域的深度
DNA分型数据
≥ 100 倍 (DNA分型数据准确性测试)倍7.2.3 a) 2)
检测结果限值判定(演示)
检测项目
测定结果
判定逻辑:测定结果与限值直接比对(未含测量不确定度保护带),正式报告请按 ILAC-G8 / 标准原文复核。
就这本标准问我
回答基于本标准的结构化解析与条款文本检索生成,附条款溯源;AI 解读请以标准正式原文为准。
看完方法,直接落成原始记录:自动带出检测要求与质控核查项,录读数自动计算判定,可导出活公式 Excel
DNA测序数据准确性测试7.2.1
运行DNA数据质量测试工具,检测单碱基质量值Qn和碱基个数nb,计算单碱基准确率Bn,再计算DNA测序数据准确率Ai。
仪器 1 项试剂 0 项步骤 3 步
仪器设备
高通量基因测序仪(符合YY/T 1723—2020规定)
分析步骤
1运行DNA数据质量测试工具,打开需要测试的DNA测序数据文件,检测并得到DNA测序数据中单碱基的质量值Qn和碱基个数nb。
2根据单碱基质量值,按照公式(1)计算单碱基准确率Bn。
3由单碱基准确率,根据公式(2)计算DNA测序数据准确率Ai。
DNA比对数据准确性测试7.2.2
运行DNA数据质量测试工具,检测单个片段比对质量值MAPQn和比对到参考序列的测序片段总数nR,计算单测序片段比对准确率Rn,再计算DNA比对数据准确率AR。
仪器 0 项试剂 0 项步骤 3 步
分析步骤
1运行DNA数据质量测试工具,打开需要测试的DNA比对数据文件,检测并得到DNA比对数据中单个片段比对质量值MAPQn和比对到参考序列的测序片段总数nR。
2根据DNA比对数据中单个片段比对质量值,按照公式(3)计算每个片段的单测序片段比对准确率Rn。
3由DNA比对数据中单个片段比对质量值,根据公式(4)计算DNA比对数据准确率AR。
DNA分型数据准确性测试7.2.3
运行DNA数据质量测试工具,检测单个基因分型质量值GQn和分型位点(基因座)总数nG,计算单个基因分型准确率Tn,再计算DNA分型数据准确率AT。
仪器 0 项试剂 0 项步骤 3 步
分析步骤
1运行DNA数据质量测试工具,打开需要测试的DNA分型数据文件,检测并得到DNA分型数据中单个基因分型质量值GQn和分型位点(基因座)总数nG。
2根据DNA分型数据中单个基因分型质量值GQn,按照公式(5)计算单个基因分型准确率Tn。
3由DNA分型数据中单个基因分型准确率,根据公式(6)计算DNA分型数据准确率AT。
DNA测序数据完备性测试7.3.1
仪器 0 项试剂 0 项步骤 5 步
分析步骤
1检测是否包含样本信息文件,样本信息文件中是否包含对应的样本名称、样本类型。
2检测是否包含测序关联信息文件,测序关联信息文件中是否包含测序仪器(编号、版本号)、测序芯片标识、测序文库标识和DNA测序数据文件名称。
3检测是否包含DNA测序数据文件。
4检测是否具有DNA测序数据对应的MD5值。
5检测以上文件是否具有备份文件。
DNA比对数据完备性测试7.3.2
仪器 0 项试剂 0 项步骤 5 步
分析步骤
1检测是否包含样本信息文件,样本信息文件中是否包含对应的样本名称、样本类型。
2检测是否包含比对关联信息文件,测序关联信息文件中是否包含测序仪器(编号、版本号)、测序芯片标识、测序文库标识、DNA测序数据文件名称和DNA比对数据文件名称。
3检测是否包含DNA比对数据文件。
4检测是否具有DNA比对数据对应的MD5值。
5检测以上文件是否具有备份文件。
DNA分型数据完备性测试7.3.3
仪器 0 项试剂 0 项步骤 5 步
分析步骤
1检测是否包含样本信息文件,样本信息文件中是否包含对应的样本名称、样本类型。
2检测是否包含分型关联信息文件,分型关联信息文件中是否包含测序仪器(编号、版本号)、测序芯片标识、测序文库标识、DNA测序数据文件名称、DNA比对数据文件名称和DNA分型数据文件名称。
3检测是否包含DNA分型数据文件。
4检测是否具有DNA分型数据对应的MD5值。
5检测以上文件是否具有备份文件。
DNA数据可溯性测试方法7.4
仪器 0 项试剂 0 项步骤 3 步
分析步骤
1运行DNA数据质量测试工具,生成所有DNA数据的文件名称和MD5值。
2打开测序关联信息文件、比对关联信息文件、分型关联信息文件,检测各个关联信息文件中的所有DNA数据的MD5值与DNA数据质量测试工具生成的所有DNA数据的文件名称和MD5值的一致性。
3打开DNA测序数据样本信息文件、DNA比对数据样本信息文件、DNA分型数据样本信息文件,检测各个样本信息文件中的样本名称、样本类型与样本原始信息是否一致。
公式已就位——生成原始记录后,这些公式将变成 Excel 里的活公式,改读数自动重算重判
单碱基准确率7.2.1 b) 2) 公式(1)
B_n = 1 - 10^(Q_n/10)
计算表达式(可直接用于 Excel/程序)
B_n = 1 - 10^(Q_n/10)
Q_n单碱基的质量值
B_n单碱基准确率
DNA测序数据准确率7.2.1 b) 3) 公式(2)
A_i = \dfrac{Σ_{1}^{n} B_n}{n_b}
计算表达式(可直接用于 Excel/程序)
A_i = (Σ_{1}^{n} B_n) / n_b
B_n单碱基准确率
n_b碱基个数
A_iDNA测序数据准确率
单测序片段比对准确率7.2.2 b) 2) 公式(3)
R_n = 1 - 10^(MAPQ_n/10)
计算表达式(可直接用于 Excel/程序)
R_n = 1 - 10^(MAPQ_n/10)
R_nDNA比对数据中单个片段的单测序片段比对准确率
MAPQ_nDNA比对数据中单个片段比对质量值
DNA比对数据准确率7.2.2 b) 3) 公式(4)
A_R = \dfrac{Σ_{1}^{n} R_n}{n_R}
计算表达式(可直接用于 Excel/程序)
A_R = (Σ_{1}^{n} R_n) / n_R
R_nDNA比对数据中单个片段的单测序片段比对准确率
n_RDNA比对数据中比对到参考序列的测序片段总数
A_RDNA比对数据准确率
单个基因分型准确率7.2.3 b) 2) 公式(5)
T_n = 1 - 10^(GQ_n/10)
计算表达式(可直接用于 Excel/程序)
T_n = 1 - 10^(GQ_n/10)
T_nDNA分型数据中单个基因分型准确率
GQ_nDNA分型数据中单个基因分型质量值
DNA分型数据准确率7.2.3 b) 3) 公式(6)
A_T = \dfrac{Σ_{1}^{n} T_n}{n_G}
计算表达式(可直接用于 Excel/程序)
A_T = (Σ_{1}^{n} T_n) / n_G
T_nDNA分型数据中单个基因分型准确率
n_G分型位点(基因座)总数
A_TDNA分型数据准确率
标准中"施加在执行过程与条件上的要求"(C1 环境 / C4 样品 / C6 质控 / C7 条件限值 / C8 适用范围 / C9 过程参数),是原始记录模板与自动核查的数据源。
C5 · 设备能力要求测序数据 · 读长
≥ 50 bpDNA数据质量测试工具要求出处:7.4
C5 · 设备能力要求测序数据 · Q30
≥ 85 %DNA数据质量测试工具要求出处:7.4
C5 · 设备能力要求测序数据 · 读长
≥ 50 bpDNA数据质量测试工具要求出处:7.4
C5 · 设备能力要求目标区域 · 覆盖度
≥ 95 %DNA数据质量测试工具要求出处:7.4
C5 · 设备能力要求目标区域 · 平均测序深度
≥ 100 倍DNA数据质量测试工具要求出处:7.4
C5 · 设备能力要求目标区域 · 覆盖度
≥ 95 %DNA数据质量测试工具要求出处:7.4
C5 · 设备能力要求目标区域 · 深度
≥ 100 倍DNA数据质量测试工具要求出处:7.4
C6 · 精密度/质控限强制DNA测序数据 · 准确率
≥ 99 %DNA测序数据质量出处:7.4
C6 · 精密度/质控限强制DNA比对数据 · 准确率
≥ 95 %DNA比对数据质量出处:7.4
C6 · 精密度/质控限强制DNA分型数据 · 准确率
≥ 98 %DNA分型数据质量出处:7.4
C6 · 精密度/质控限强制DNA测序数据可追溯信息 · 与DNA样本可追溯信息一致性
≥ 100 %DNA测序数据可追溯性出处:7.4
C6 · 精密度/质控限强制DNA比对数据可追溯信息 · 与DNA样本可追溯信息一致性
≥ 100 %DNA比对数据可追溯性出处:7.4
C6 · 精密度/质控限强制DNA分型数据可追溯信息 · 与DNA样本可追溯信息一致性
≥ 100 %DNA分型数据可追溯性出处:7.4
GB/T 35890—2018高通量测序数据序列格式规范版本绑定规范性引用
YY/T 1723—2020高通量基因测序仪版本绑定规范性引用
不直接构成认可能力认可领域:未识别
本标准为基础标准,属管理/基础/参考类文件,不直接构成检测能力;CNAS 能力范围中无需为其单列检测能力条目。
解析模型与复核模型对以下关键数值意见不一。 点击您认可的一侧卡片即可投票,多数人的意见即最终结论;每项仅可投一次,首次投票 +2 LP。 已定案项目会在正文对应位置标注 ⚖,悬停可见两模型的分歧详情。
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